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Tracking und Style ist die meiste Anwendung von Javascript. <script> wird nur zum Aufrufen von Java bzw Scripten benutzt. Du kannst aber fast alles damit Programmieren, deswegen wird damit auch viel quatsch gemacht. Ein Framework ist ein vorgebauter Baukasten, den du benutzen kannst. Ein iFrame...

Dafür gibt es die Media Queries. Die sind für Einstellungen, wenn die Bildschirmgröße variiert und werden einfach in die css eingetragen. Mit .htaccess habe ich in dem Zusammenhang noch nie gehört.

zu 1. hier ein Beispiel: https://stackoverflow.com/questions/23761478/js-using-onclick-event-on-li-to-display-block geht auch mit jQuery mit einem slide.Toggle zu 3. mach dich erstmal mit der @media Rolle vertraut. Mehr brauchst du nicht, wenn du nicht professionell Webseiten erstellen...